En cada operación que se realiza en el sistema (facturas, pagos, etc.), se genera automáticamente el correspondiente asiento contable. Técnicamente, ambas operaciones se generan en una única transacción, por lo tanto se genera el documento con su asiento y en caso de falla, no se genera ninguno de los dos. Este mecanismo asegura la integridad entre los datos de gestión y los asientos contables.

Para el usuario que opera el sistema, el hecho de que se estén generando los asientos contables mientras genera operaciones no implica ningún cambio en su forma de trabajo, ya que el sistema no solicita ninguna intervención para generar el respectivo asiento. El asiento se generará de acuerdo a la parametrización realizada de antemano en el sistema.

Cada asiento se genera en un libro contable cargado en el sistema. En algunas empresas generan todos los asientos en un único libro, denominado libro diario. En otras empresas, la mayoría, no desean tener un libro diario tan extenso (considerar que por cada factura de venta se genera un asiento). En estos casos, se crean varios libros, por ejemplo, el libro de compras, de ventas y el diario. De esta forma, cada asiento se genera en su respectivo libro y con la frecuencia deseada, se resumen los asientos de un libro en otro. Por ejemplo, las ventas se pueden generar en el libro de ventas y mensualmente se genera un asiento resumen en el libro diario. De esta forma, el libro diario queda más pequeño y el detalle de las ventas se conserva en el libro de ventas.

El sistema brinda la posibilidad de volver a generar los asientos existentes. Con este mecanismo, pueden realizarse cambios en la lógica de la generación de asientos o en la estructura del plan de cuentas y luego volver a generar todos los asientos. La regeneración de asientos permite trabajar con la tranquilidad de saber que durante la puesta a punto de la contabilidad, se pueden ajustar los parámetros y volver a generar la misma hasta asegurarse que se realiza en forma correcta. Así mismo, se puede comenzar a trabajar con Fierro sin el módulo contable y en algún momento implementarlo. Se podrá regenerar la contabilidad en los datos ya cargados.